1.弱陽性質控：需要準備弱陽性質控，包括標準物質、第三方質控或弱陽性樣品用于進行性能質控和抑制物質控。
2.陰性質控：需要準備確定陰性的樣品或空白對照，用于進行污染物的質控。
3.重復次數n：中國人喜歡3(三顧茅廬),6（六六大順）,8（）,9（九九），很遺憾這些數和實驗室都關系不太大。符合統計學計算的的兩個數字是5和20,5通常是能進行統計學分析的少重復次數，20通常用于計算95%的置信區間。大家根據自己的需要選擇合適的重復次數。
1.進入各工作區域應當按照單一方向進行，即試劑儲存和準備區→標本制備區→擴增區→擴增產物分析區。
2.各區域的設備、清潔用具標記明確，不得混用。
3.各區域的衣服用不同顏色標記，離開各區域時不得將工作服帶出。
4.試驗臺用移動式紫外線燈消毒，高度60-90cm。擴增區延長照射時間，是過夜照射。同時各區域還需安裝懸掛式紫外線燈管。
5.各試驗區盡量避免不必要的走動和進出，減少風險。
6.擴增產物分析區可能會用到某些可致基因突變和有毒物質，應特別注意實驗人員的安全防護。
試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓，以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入，造成污染；
可以通過控制進風風量大于排風風量達到正壓效果。
核酸擴增室及產物分析室應呈微負壓，以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品，可以通過控制排風風量大于進風風量達到負壓效果。
在理想情況下，PCR實驗室緩沖間內，可設置正壓，使室內空氣不流向室外，室外空氣不流向室內。
PCR實驗室進風由原有中央空調控制，要求將中央空調風口安裝到，且高度為地面鋪裝好后2600mm處。
如果使用熒光PCR儀，擴增室和產物分析室可以合并。
若房間進深允許，可設PCR內部走廊。需要指出的是在減少室內外空氣交換方面，緩沖間比走廊更有意義。
各個區域之間應具備單向的實驗工藝流、物流、與氣流，形成單向流程的保護屏障，避免實驗之間的相互干擾，防止核酸氣溶膠對實驗過程造成污染產生假性結果。
實驗室的墻體，包括頂棚，應結構牢固、氣密性好；所有陰角宜采用圓弧形線條過渡；墻體內壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒；地面材料應滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。
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